Badan pengurus Boedi Oetomo mengajukan anggaran dasar kepada pemerintah kolonial. Awal Oktober 1909, Boedi Oetomo menyelenggrakan konggres untuk menentukan arah perjuangan organisasi. Konggres itu berjalan alot, kaum tua seperti Wahidin Sudirohusodo dan Radjiman Wedyodiningrat menghendaki pendidikan untuk kaum priyayi, sementara kaum muda seperti Tjipto Mangunkusumo dan Soetomo justru menghendaki pendidikan bagi seluruh rakyat.