Bondan tutup usia karena kanker paru. Bondan dan istrinya, Molly Warner, seorang simpatisan kemerdekaan Indonesia dan bekerja sebagai sekretaris Asosiasi Indonesia-Australia, kembali ke Tanah Air. Bondan bekerja sebagai kepala Bagian Pelatihan Kementerian Pembangunan dan Pemuda Kabinet Hatta pada awal 1949. Sedangkan Molly kerja di Departemen Penerangan.