Pada Juli 1825, pasukan Belanda pun menyerbu kediaman Diponegoro. Namun, Diponegoro berhasil lolos bersama istri dan pasukannya ke arah barat. Mereka pergi menuju tempat persembunyian yang aman, yaitu Gua Selarong.
Rencana pemberontakan PKI yang diputuskan dalam Konferensi Prambanan ditentang Tan Malaka dan Komunis Internasional. Perpecahan juga terjadi di dalam tubuh PKI.